Protein–RNA interactions for Protein: O08686

Barx2, Homeobox protein BarH-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx2O08686 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Barx2O08686 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Barx2O08686 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Barx2O08686 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Barx2O08686 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms