Protein–RNA interactions for Protein: O08576

Rundc3a, RUN domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3aO08576 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rundc3aO08576 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rundc3aO08576 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 442.8 ms