Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ascl4M0QW46 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ascl4M0QW46 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms