Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8857L7N291 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8857L7N291 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8857L7N291 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8857L7N291 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8857L7N291 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8857L7N291 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8857L7N291 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8857L7N291 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8857L7N291 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8857L7N291 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8857L7N291 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8857L7N291 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8857L7N291 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms