Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Zfp955bL7N232 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms