Protein–RNA interactions for Protein: L7N1W8

Vmn2r88, Vomeronasal 2, receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r88L7N1W8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Vmn2r88L7N1W8 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Vmn2r88L7N1W8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms