Protein–RNA interactions for Protein: L7MTU6

Ifnab, Interferon alpha B, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IfnabL7MTU6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
IfnabL7MTU6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IfnabL7MTU6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms