Protein–RNA interactions for Protein: K7N6B6

Vmn1r168, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r168K7N6B6 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r168K7N6B6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r168K7N6B6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r168K7N6B6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r168K7N6B6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r168K7N6B6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r168K7N6B6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r168K7N6B6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r168K7N6B6 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r168K7N6B6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vmn1r168K7N6B6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r168K7N6B6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms