Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm2056J3QQ02 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm2056J3QQ02 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms