Protein–RNA interactions for Protein: J3QPW6

1700122O11Rik, MCG53587, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700122O11RikJ3QPW6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
1700122O11RikJ3QPW6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
1700122O11RikJ3QPW6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms