Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3685J3QPP2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3685J3QPP2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3685J3QPP2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm3685J3QPP2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm3685J3QPP2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm3685J3QPP2 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm3685J3QPP2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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