Protein–RNA interactions for Protein: J3QNU5

Gm21798, Predicted gene, 21798, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21798J3QNU5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Gm21798J3QNU5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms