Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
Ccdc180J3QNE4 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccdc180J3QNE4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccdc180J3QNE4 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms