Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm21972J3QN38 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21972J3QN38 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms