Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm20918J3QN17 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20918J3QN17 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20918J3QN17 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20918J3QN17 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm20918J3QN17 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm20918J3QN17 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm20918J3QN17 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm20918J3QN17 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm20918J3QN17 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm20918J3QN17 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20918J3QN17 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20918J3QN17 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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