Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21060J3KMU4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21060J3KMU4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21060J3KMU4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21060J3KMU4 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21060J3KMU4 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21060J3KMU4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21060J3KMU4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21060J3KMU4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21060J3KMU4 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21060J3KMU4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm21060J3KMU4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Gm21060J3KMU4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms