Protein–RNA interactions for Protein: I6L890

Casp16-ps, Caspase 16, apoptosis-related cysteine peptidase, pseudogene, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp16-psI6L890 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Casp16-psI6L890 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Casp16-psI6L890 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms