Protein–RNA interactions for Protein: I3ITR1

AK157302, MCG50313, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AK157302I3ITR1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
AK157302I3ITR1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
AK157302I3ITR1 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
AK157302I3ITR1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms