Protein–RNA interactions for Protein: H3BKF4

Gm20708, Predicted gene 20708, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20708H3BKF4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20708H3BKF4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm20708H3BKF4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm20708H3BKF4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm20708H3BKF4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms