Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Taf4bG5E8Z2 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Taf4bG5E8Z2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
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