Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

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Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Usp17lcG5E8I7 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Usp17lcG5E8I7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms