Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G1

Vmn1r12, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r12G5E8G1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vmn1r12G5E8G1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms