Protein–RNA interactions for Protein: G3X9K3

Arfgef1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,846 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef1G3X9K3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Arfgef1G3X9K3 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Arfgef1G3X9K3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Arfgef1G3X9K3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms