Protein–RNA interactions for Protein: G3X964

2610008E11Rik, RIKEN cDNA 2610008E11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610008E11RikG3X964 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
2610008E11RikG3X964 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
2610008E11RikG3X964 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms