Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NpcdF8VQB8 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NpcdF8VQB8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms