Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ07

5830473C10Rik, RIKEN cDNA 5830473C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5830473C10RikF8VQ07 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
5830473C10RikF8VQ07 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
5830473C10RikF8VQ07 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms