Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC33.79■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC33.79■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC33.78■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC33.78■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC33.77■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
BicraF8VPZ9 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
BicraF8VPZ9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC33.69■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
BicraF8VPZ9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms