Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gm28048F7BCN0 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm28048F7BCN0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms