Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
D430041D05RikF6ZGR6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC25■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
D430041D05RikF6ZGR6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
D430041D05RikF6ZGR6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms