Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Neurod6-201ENSMUST00000044767 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Gm20538F6Z9R1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.81□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Gm20538F6Z9R1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.8□□□□□ -1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms