Protein–RNA interactions for Protein: F6V0H0

Pagr1b, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1B (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1bF6V0H0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pagr1bF6V0H0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Pagr1bF6V0H0 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms