Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
4933403O08RikF6UK53 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933403O08RikF6UK53 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933403O08RikF6UK53 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933403O08RikF6UK53 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933403O08RikF6UK53 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933403O08RikF6UK53 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933403O08RikF6UK53 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
4933403O08RikF6UK53 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933403O08RikF6UK53 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933403O08RikF6UK53 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
4933403O08RikF6UK53 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
4933403O08RikF6UK53 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4933403O08RikF6UK53 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms