Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Sptbn5F6UCX4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Sptbn5F6UCX4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms