Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rnf165E9QAU8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rnf165E9QAU8 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rnf165E9QAU8 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rnf165E9QAU8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rnf165E9QAU8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rnf165E9QAU8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms