Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Lmod3E9QA62 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Lmod3E9QA62 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Lmod3E9QA62 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms