Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cdh18E9Q9Q6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cdh18E9Q9Q6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms