Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp31E9Q6Y8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp31E9Q6Y8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms