Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E5

Srsf11, Serine/arginine-rich-splicing factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf11E9Q6E5 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Srsf11E9Q6E5 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Srsf11E9Q6E5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms