Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ythdc1E9Q5K9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Ythdc1E9Q5K9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ythdc1E9Q5K9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms