Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5F9

Setd2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, mousemouse

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Length 2,537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd2E9Q5F9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Setd2E9Q5F9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Setd2E9Q5F9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Setd2E9Q5F9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Setd2E9Q5F9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Setd2E9Q5F9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Setd2E9Q5F9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Setd2E9Q5F9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
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Setd2E9Q5F9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Setd2E9Q5F9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Setd2E9Q5F9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Setd2E9Q5F9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Setd2E9Q5F9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Setd2E9Q5F9 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Setd2E9Q5F9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Setd2E9Q5F9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Setd2E9Q5F9 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Setd2E9Q5F9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Setd2E9Q5F9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Setd2E9Q5F9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Setd2E9Q5F9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Setd2E9Q5F9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Setd2E9Q5F9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Setd2E9Q5F9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms