Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DspE9Q557 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DspE9Q557 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DspE9Q557 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DspE9Q557 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DspE9Q557 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DspE9Q557 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DspE9Q557 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms