Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ApobE9Q414 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC11.43□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.43□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.43□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
ApobE9Q414 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
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