Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3L6

4930579F01Rik, RIKEN cDNA 4930579F01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930579F01RikE9Q3L6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
4930579F01RikE9Q3L6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930579F01RikE9Q3L6 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms