Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3G8

Nup153, Nucleoporin 153, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup153E9Q3G8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup153E9Q3G8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nup153E9Q3G8 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nup153E9Q3G8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Nup153E9Q3G8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nup153E9Q3G8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nup153E9Q3G8 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms