Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc171E9Q1U1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc171E9Q1U1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc171E9Q1U1 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
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