Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1M1

Pdzd2, PDZ domain-containing 2, mousemouse

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Length 2,796 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd2E9Q1M1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Pdzd2E9Q1M1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Pdzd2E9Q1M1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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