Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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Zfp558E9Q1J0 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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Zfp558E9Q1J0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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Zfp558E9Q1J0 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zfp558E9Q1J0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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Zfp558E9Q1J0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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Zfp558E9Q1J0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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Zfp558E9Q1J0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
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Zfp558E9Q1J0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Zfp558E9Q1J0 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Zfp558E9Q1J0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
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Zfp558E9Q1J0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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Zfp558E9Q1J0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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