Protein–RNA interactions for Protein: E9Q053

Gm9972, Predicted gene 9972, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9972E9Q053 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm9972E9Q053 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm9972E9Q053 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms