Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Brd1E9PZ26 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Brd1E9PZ26 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms