Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm5415E9PXF3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5415E9PXF3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5415E9PXF3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5415E9PXF3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5415E9PXF3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5415E9PXF3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5415E9PXF3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm5415E9PXF3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms